Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rpusd3Q14AI6 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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Rpusd3Q14AI6 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rpusd3Q14AI6 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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