Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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Hoxd1Q01822 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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Hoxd1Q01822 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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