Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprmP28828 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprmP28828 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PtprmP28828 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PtprmP28828 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprmP28828 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PtprmP28828 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprmP28828 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprmP28828 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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