Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RxraP28700 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RxraP28700 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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