Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd12P23812 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms