Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TP20293 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TP20293 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TP20293 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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