Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms