Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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Spocd1B1ASB6 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Spocd1B1ASB6 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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