Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col4a3Q9QZS0 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms