Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms