Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln8Q9QUK3 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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