Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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