Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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