Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rprd1bQ9CSU0 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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