Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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