Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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