Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms