Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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