Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Rpl28P41105 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms