Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PtprmP28828 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PtprmP28828 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprmP28828 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PtprmP28828 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtprmP28828 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtprmP28828 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PtprmP28828 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.56□□□□□ -2
PtprmP28828 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PtprmP28828 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprmP28828 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 852.5 ms