Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Spta1P08032 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Spta1P08032 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Spta1P08032 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Spta1P08032 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Spta1P08032 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Spta1P08032 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Spta1P08032 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Spta1P08032 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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