Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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