Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms