Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Zbed3Q9D0L1 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Zbed3Q9D0L1 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms