Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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