Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Cldn16Q925N4 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Cldn16Q925N4 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Cldn16Q925N4 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Cldn16Q925N4 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Cldn16Q925N4 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Cldn16Q925N4 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Cldn16Q925N4 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Cldn16Q925N4 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Cldn16Q925N4 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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