Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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Trim17Q7TPM3 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim17Q7TPM3 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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