Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NipblQ6KCD5 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms