Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Hoxa13Q62424 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms