Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Sft2d1Q5SSN7 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Sft2d1Q5SSN7 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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