Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Trim71Q1PSW8 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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