Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
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ptchd1Q14B62 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
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ptchd1Q14B62 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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ptchd1Q14B62 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ptchd1Q14B62 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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