Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Sh3bp2Q06649 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Sh3bp2Q06649 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Sh3bp2Q06649 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Sh3bp2Q06649 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Sh3bp2Q06649 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms