Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SbdsP70122 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms