Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VdrP48281 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VdrP48281 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VdrP48281 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VdrP48281 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VdrP48281 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VdrP48281 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VdrP48281 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VdrP48281 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms