Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpl28P41105 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms