Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RxraP28700 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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