Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DffaO54786 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DffaO54786 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DffaO54786 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DffaO54786 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DffaO54786 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DffaO54786 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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