Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-M1F7CXU4 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-M1F7CXU4 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms