Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms