Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Spocd1B1ASB6 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Spocd1B1ASB6 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms