Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
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