Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trbv21A0A0A6YX06 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trbv21A0A0A6YX06 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms