Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn8Q9Z260 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms