Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Limd1Q9QXD8 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms