Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Cln8Q9QUK3 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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