Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RabggtaQ9JHK4 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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