Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms