Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn16Q925N4 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms