Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Usp38Q8BW70 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Usp38Q8BW70 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Usp38Q8BW70 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Usp38Q8BW70 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Usp38Q8BW70 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Usp38Q8BW70 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms